Det hovedforskel mellem reparation af mismatch og reparation af nukleotider er det mismatch repair (MMR) er ansvarlig for fjernelse af basismismatch og små indsættelses-/deletionssløjfer, der indføres under DNA -replikation, hvorimod nucleotide excision repair (NER) er ansvarlig for fjernelse af en række forskellige DNA -skader, der opstår på grund af ultraviolet stråling. Desuden undergår celler fejlparring umiddelbart efter DNA -syntese, mens celler undergår nukleotid -udskæring, hvis DNA bliver beskadiget.

Uoverensstemmelse reparation og nukleotid udskæring reparation er to mekanismer, der forhindrer mutationer og andre permanente ændringer i DNA -sekvensen.

DNA -skader, DNA -reparation, uoverensstemmelsesreparation (MMR), reparation af nukleotid excision (NER), replikationsfejl

Hvad er uoverensstemmelse reparation

Mismatch -reparation (MMR) er en DNA -reparationsmekanisme, der opstår lige efter DNA -replikation. Derfor er hovedformålet med denne mekanisme at fjerne og erstatte fejlparrede baser, som ikke er fikset ved korrekturlæsning. Desuden registrerer og korrigerer den små indsættelser og deletioner, der opstår på grund af glidninger af DNA -polymerasen.

Figur 1: Reparationsmekanisme for uoverensstemmelse

Normalt er de tre proteiner i E. coli mismatch -reparationssystemet MutS, MutL og MutH. På den anden side indeholder eukaryoter kun det homologe for MutS og MutL. Hos mennesker binder MutS-homolog heterodimer, MSH2-MSH6 til uoverensstemmelsen, mens MSH2-MSH6 og MSH2-MSH3 kan binde sig til insertions/deletions loop. Derefter nedbrydes den nysyntetiserede streng, hvilket fjerner uoverensstemmelsen ved virkningen af ​​EXO1. Herefter fuldender resyntese af DNA og ligering uoverensstemmelsen.

Hvad er Nucleotide Excision Repair

Nucleotide excision repair (NER) er en DNA -reparationsmekanisme til fjernelse og udskiftning af beskadigede nukleotider. Generelt registrerer og korrigerer denne mekanisme DNA -skader, som forvrænger DNA -dobbeltspiral. Det er; denne vej detekterer nukleotider og modificeres med omfangsrige kemiske grupper knyttet til DNA såsom kemikalier i cigaretrøg. Endvidere reparerer nukleotid -udskæringsreparationsvejen DNA -skader forårsaget af UV -stråling. Her får UV -stråling thymin og cytosinbaser til at reagere med deres tilstødende nukleotider. De resulterende bindinger forvrænger imidlertid den dobbelte helix og forårsager fejl i DNA -replikation. Her er den mest almindelige type af disse bindinger thymindimerer, der består af to thyminnukleotider reageret sammen.

Figur 2: Reparation af nukleotid excision

Ligheder mellem reparation af uoverensstemmelse og reparation af nukleotider

Forskellen mellem reparation af uoverensstemmelse og reparation af nukleotider

Definition

Fejlmatchreparation (MMR) refererer til et DNA -reparationssystem, hvorved et medlem af et par baser, der ikke matcher hinanden, konverteres til den normalt matchede base, mens nukleotid excisionsreparation (NER) refererer til hovedvejen, der bruges af pattedyr til at fjerne omfangsrige DNA -læsioner som dem dannet af UV -lys.

Betydning

Celler undergår reparation af uoverensstemmelse umiddelbart efter DNA -syntese, mens celler undergår nukleotid udskæringsreparation med forekomst af DNA -skader.

Type reparation

Uoverensstemmelse reparation erstatter uoverensstemmelser og indsættelse/sletning sløjfer, som ikke repareres ved korrekturlæsning, mens nukleotid udskæring reparation erstatter DNA skader forårsaget af UV -stråling eller kemikalier i cigaretrøg.

Excision ved

Exonuclease 1 udskærer uoverensstemmende DNA i fejlparringsreparationsmekanismen, mens transkriptionsfaktorerne, XPG og XPF-ERCC1 udskærer det beskadigede DNA i nukleotid-excisionsreparationsmekanismen.

Konklusion

Uoverensstemmelsesreparation er mekanismen til DNA -reparation, der erstatter de uoverensstemmelser og indsættelses-/sletningssløjfer, der er inkorporeret under DNA -replikation. Generelt er disse uoverensstemmelser de undslupne under korrekturlæsning. På den anden side er reparation af nukleotid udskæring en anden mekanisme til DNA -reparation, som erstatter det beskadigede DNA med UV -stråling. Derfor opstår fejlparring reparation lige efter DNA -replikation. Imidlertid forekommer mekanismer til reparation af nukleotider ved forekomst af DNA -skader. Hovedfunktionen for begge mekanismer er at forhindre mutationer og andre permanente ændringer i DNA. Således er hovedforskellen mellem reparation af mismatch og reparation af nukleotider udskæring typen af ​​reparation.

Referencer:

1. Fleck, O. "DNA -reparation." Journal of Cell Science, bind. 117, nej. 4, 2004, s. 515–517., Doi: 10.1242/jcs.00952.

Billede høflighed:

1. "DNA mismatch repair Ecoli" Af Kenji Fukui (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia 2. "Nucleotide Excision Repair-journal.pbio.0040203.g001" Af Jill O. Fuss, Priscilla K. Cooper (CC BY 2.5) via Commons Wikimedia