Hovedforskel - Genomics vs Proteomics

Genomik, proteomik og metabolomik er de felter, der er involveret i undersøgelsen og klassificering af levende ting ved hjælp af deres genomer, proteinprodukterne syntetiseret baseret på de genetiske instruktioner og typen af ​​molekyler, de metaboliserer, henholdsvis. Genomik og proteomik er nært beslægtede områder. Det hovedforskel mellem genomik og proteomik er det genomics er undersøgelsen af ​​hele sættet af gener i genomet i en celle, mens proteomics er undersøgelsen af ​​hele sæt proteiner, der produceres af cellen. Metabolomics er derimod undersøgelsen af ​​hele sættet af lavmolekylære forbindelser, der fungerer som substrater og biprodukter af en celles enzymatiske reaktioner.

Nøgleområder omfattet

1. Hvad er Genomics - Definition, teknikker, klassificering 2. Hvad er Proteomics - Definition, teknikker, klassificering 3. Hvad er lighederne mellem Genomics og Proteomics - Oversigt over fælles funktioner 4. Hvad er forskellen mellem Genomics og Proteomics - Sammenligning af vigtige forskelle

Nøglebetingelser: Gener, Genomics, Human Genome Project (HGP), Human Proteome Project (HPP), Proteiner, Proteom, Proteomics

Hvad er Genomics

Genomics refererer til undersøgelsen af ​​hele sæt gener i et genom. Genomet er det komplette sæt genetisk information om en organisme, hovedsageligt bestående af DNA. Høj gennemløbsteknik bruges i genomikken til at kortlægge, sekvensere og analysere genomer. Teknikkerne, der er involveret i genomik, omfatter gensekventeringsstrategier såsom rettet gensekvensering, helgenoms haglgeværsekvensering, konstruktion af udtrykte sekvensmærker (EST'er), identifikation af enkeltnukleotidpolymorfier (SNP'er) og analyse og fortolkning af sekventerede data ved hjælp af forskellig software og databaser. De vigtigste trin i haglgeværsekventeringen er vist i figur 1.

Figur 1: Environmental Shotgun Sequencing (ESS)Prøvetagning, (B) filtrering af partikler, (C) DNA -ekstraktion og analyse, (D) kloning og bibliotek, (D) sekvensering, (E) sekvenssamling

De to hovedområder i genomikken er strukturel genomik og funktionel genomik. I strukturel genomik, strukturen og de relative positioner af generne studeres, mens de er i funktionel genomikundersøges genernes funktion eller rolle i de regulerende metaboliske aktiviteter. Genomsekvensprojekter er den seneste udvikling inden for genomik. Human Genome Project (HGP) blev afsluttet i 2003. Målene med Human Genome Project var:

Ud over det humane genom har mus- og risgener også været udsat for genomiske undersøgelser.

Hvad er Proteomics

Proteomics refererer til undersøgelsen af ​​hele sæt proteiner produceret af en celle. Proteomet er det komplette sæt proteiner, der produceres af cellen. I proteomik udføres karakterisering af 3D -strukturen og funktionen af ​​proteiner ved brug af metoder med høj kapacitet. Teknikker involveret i proteomik omfatter ekstraktion og elektroforetisk adskillelse af proteiner, fordøjelse af proteiner ved anvendelse af trypsin i små fragmenter, bestemmelse af aminosyresekvensen ved massespektrometri og identifikation af proteiner ved hjælp af informationen i proteindatabaserne. Desuden kan proteinets 3D-struktur forudsiges ved hjælp af software-baserede metoder. Ekspressionen af ​​proteiner kan studeres ved hjælp af proteinmikroarrays. Protein-netværkskort kan udvikles til at bestemme protein-protein-interaktioner. Forskellige fænomener i proteomik er vist i figur 2.

Figur 2: Proteomics

Proteinprodukter af generne i det humane genom undersøges under Human Proteome Project (HPP). Et af hovedformålene med Human Proteome Project er at identificere de proteiner, der er involveret i de større sygdomme.

Ligheder mellem Genomics og Proteomics

Forskellen mellem genomik og proteomik

Definition

Genomik: Genomics refererer til undersøgelsen af ​​hele sæt gener i et genom.

Proteomics: Proteomics refererer til undersøgelsen af ​​hele sæt proteiner produceret af en celle.

Fænomener

Genomik: Genomik involverer kortlægning, sekventering og analyse af genomer.

Proteomics: Proteomics involverer 3D-struktur og funktion af proteiner og protein-protein-interaktioner.

Klassifikation

Genomik: De to typer genomik er strukturel genomik og funktionel genomik.

Proteomics: De tre typer proteomik er strukturel, funktionel og ekspressionsproteomik.

Vigtige områder

Genomik: Genom -sekventeringsprojekter som Human Genome Project er de vigtige områder inden for genomik.

Proteomics: Proteome databaseudviklinger som SWISS-2DPAGE og softwareudvikling til computerstøttet lægemiddeldesign er de vigtige områder inden for proteomik.

Konklusion

Genomik og proteomik er to videnskabelige områder, der bruges til undersøgelse af organismer. Genomics er undersøgelsen af ​​hele sættet af gener i en organisme, mens proteomik er undersøgelsen af ​​hele sæt proteiner, der produceres af cellen. Hovedforskellen mellem genomik og proteomik er kriterierne for hvert felt under undersøgelsen af ​​organismer.

Reference:

1. Griffiths, Anthony JF. "Genomik: et overblik." En introduktion til genetisk analyse. 7. udgave., U.S.National Library of Medicine, 1. januar 1970, tilgængelig her.2. Grænseløs. "Genomik og proteomik." Genomik og proteomik | Grænseløs biologi, tilgængelig her. Graves, Paul R. og Timothy A.J. Haystead. "Molekylærbiologguide til proteomik." Mikrobiologi og molekylærbiologi anmeldelser, American Society for Microbiology, mar. 2002, tilgængelig her.

Billede høflighed:

1. "Miljø haglgevær sekvensering" Af John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg - (CC BY 2.5) via Commons Wikimedia2. “Proteomics” Af Xxl7441 på engelske Wikibooks - Overført fra en.wikibooks til Commons. (Public Domain) via Commons Wikimedia