Hovedforskel - cDNA vs genomisk DNA

Komplementært DNA (cDNA) og genomisk DNA er to typer DNA -molekyler, der bruges i forskningsforsøgene inden for molekylærbiologi. Både cDNA og genomisk DNA består af DNA -nukleotider. cDNA produceres ved omvendt transkription af det ekstraherede RNA fra væv. Typerne af RNA, der bruges til omvendt transkription, kan være total RNA, præ-mRNA, RNA, ribosomalt RNA eller tRNA. Imidlertid kan genomisk DNA isoleres direkte fra cellen. Det hovedforskel mellem cDNA og genomisk DNA er det cDNA repræsenterer transkriptomet for en bestemt organisme, mens genomisk DNA repræsenterer genomet.

Nøgleområder omfattet

1. Hvad er cDNA - Definition, fakta, rolle 2. Hvad er genomisk DNA - Definition, fakta, rolle 3. Hvad er lighederne mellem cDNA og genomisk DNA - Oversigt over fælles funktioner 4. Hvad er forskellen mellem cDNA og genomisk DNA - Sammenligning af vigtige forskelle

Nøglebetingelser: komplementært DNA (cDNA), genom, genomisk DNA (gDNA), omvendt transkription, RNA, transkriptom

Hvad er cDNA

cDNA (komplementært DNA) refererer til det syntetiske DNA, hvis basesekvenser er komplementære til DNA'et. Det er fremstillet ved omvendt transkription af RNA -skabeloner. Total RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomalt RNA eller tRNA kan bruges til revers transkription. Omvendt transkriptase er det enzym, der katalyserer reaktionen ved at producere cDNA fra RNA. Den omvendte transkription kombineret med PCR er vist i figur 1.

Figur 1: Omvendt transkription kombineret med PCR

cDNA bruges hovedsageligt til kloning af eukaryote gener i de prokaryote genomer. Exoner består af den kodende region af proteiner. I eukaryoter afbrydes den kodende region af introner. Under transkription kodes både introner og exoner til præ-mRNA. Men under mRNA -behandlingen fjernes intronerne fra mRNA og producerer et modent mRNA ved at splejse exonerne sammen. Det samlede mRNA for en organisme kaldes transkriptomet. Imidlertid mangler prokaryoter mRNA -behandlingsmekanismer. Således bruges mRNA til at syntetisere cDNA, der kun indeholder proteinkodende områder af genomet. Dette cDNA bruges til at klone gener til prokaryoter. cDNA produceres naturligt i retrovira under omdannelsen af ​​RNA -genomet til DNA.

Hvad er genomisk DNA

Genomisk DNA (gDNA) refererer til det samlede sæt kromosomalt DNA i genomet. Det samlede sæt gener af en bestemt organisme refereres til dets genom. Imidlertid er ikke kun gener i genomet aktive. De fleste grupper af organismer har lignende typer genomisk DNA i gruppen. Organismens genom overføres fra den næste generation til den anden. Generelt består genomer af et stort antal basepar. Som et eksempel består det menneskelige genom af omkring 3 milliarder basepar. Kromosomerne i det menneskelige genom er vist i figur 2.

Figur 2: Kromosomer i det menneskelige genom

De fire typer sekvenser, der findes i det genomiske DNA, er proteinkodende gener, tandemt gentagne gener, gentaget DNA og spacer-DNA. Genomisk DNA bruges i mange forsøg inden for molekylærbiologi. Isolering af genomisk DNA er let sammenlignet med fremstilling af cDNA. Genomisk DNA kan bruges som PCR -skabeloner til kloning, sekventering, forberedelse af genomiske biblioteker, DNA -fingeraftryk, undersøgelse af genstrukturer og påvisning af mutationer/abnormiteter.

Ligheder mellem cDNA og genomisk DNA

Forskellen mellem cDNA og genomisk DNA

Definition

cDNA: cDNA er det syntetiske DNA, hvis basesekvenser er komplementære til genomisk DNA.

Genomisk DNA: Genomisk DNA er det samlede sæt kromosomalt DNA i genomet.

Repræsentere

cDNA: cDNA repræsenterer transkriptomet.

Genomisk DNA: DNA repræsenterer genomet.

Syntetiseret/ekstraheret fra

cDNA: cDNA syntetiseres fra omvendt transkription af forskellige typer RNA.

Genomisk DNA: Genomisk DNA kan ekstraheres fra eksisterende genomer.

Indhold

cDNA: cDNA består af exoner eller kodende regioner.

Genomisk DNA: Genomisk DNA består af kodende og ikke-kodende sekvenser af en organisme.

Antal

cDNA: cDNA indeholder et par basepar.

Genomisk DNA: Genomisk DNA indeholder et stort antal basepar.

Brug

cDNA: cDNA bruges til at producere cDNA -biblioteker.

Genomisk DNA: Genomisk DNA kan bruges til at producere genomiske biblioteker.

Konklusion

cDNA og genomisk DNA er to typer DNA -molekyler, der bruges i forskellige typer eksperimenter inden for molekylærbiologi. cDNA syntetiseres fra RNA, og det består kun af exoner. Derfor repræsenterer det transkriptomet af en organisme. Genomisk DNA kan let ekstraheres fra cellens kerne. Det består af både kodende og ikke-kodende regioner. Det repræsenterer genomet for en bestemt organisme. Hovedforskellen mellem cDNA og genomisk DNA er typen af ​​DNA, der er til stede i hver type DNA -molekyler.

Reference:

1. "CDNA (komplementært DNA)." Menneskelige gener, tilgængelig her. “GDNA - Genomisk DNA | Avanceret analytisk (AATI). ” Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), tilgængelig her. "Genomisk DNA -isolering og applikationer." Scribd, tilgængelig her.

Billede høflighed:

1. "Revers transkription polymerasekædereaktion" Af Jpark623-Eget arbejde (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia2. "Menneskelig genom til gener" (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia